Bunga dari buah naga indah dilihat dan berbau harum. Bunganya putih dan lebar. Bunga ini hanaya mekar di malam hari dan mekarnya bertahan sampai pagi hari . Pada siang hingga sore hari bunga bunga tidak akan mekar lagi dan menjadi layu
Bunga buah naga ini dalam 1 bunganya terdapat bunga jantan dan bunga betina. JIka dilihat pada jenis buah naga yang merah , bunga betina terlihat lebih panjang daripada yang jantan. Bunga yang mekar tidak menjamin akan menjadi buah. Dikarenakan ada kalanya bunga akan rontok. Disini lah diperlukan penyerbukan yang dibantu manusia. Biasanya penyerbukan ini di lakukan pada malam hari di saat bunga sedang mekar