Tienes virus en tu pc ? debido a que metiste tu pendrive en otra y ahora todo se copia o abriste un archivo raro y todo es un desastre ...
Ya no mas tranquilízate te tengo la solución a ese problema 
Es muy fácil de utilizar lo descargas abres te pedira algunas cosas como la letra de usb o pendrive dañado
luego te dirá 100% y ya no tendrás virus en tu pc ni en el pendrive happy :) 
el programa te lo dejare aquí : http://cutw.in/qkjCL
descargarlo y veras que te resolverá mucho problemas